slurm使用相关

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本文章是我使用slurm系统时常用的一些命令，记录于此，方便查询

查看可用节点信息

查看可用节点信息可使用sinfo命令，命令详细参数如下

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Usage: sinfo [OPTIONS]
  -a, --all                  show all partitions (including hidden and those
			     not accessible)
  -b, --bg                   show bgblocks (on Blue Gene systems)
  -d, --dead                 show only non-responding nodes
  -e, --exact                group nodes only on exact match of configuration
      --federation           Report federated information if a member of one
  -h, --noheader             no headers on output
  --hide                     do not show hidden or non-accessible partitions
  -i, --iterate=seconds      specify an iteration period
      --local                show only local cluster in a federation.
                             Overrides --federation.
  -l, --long                 long output - displays more information
  -M, --clusters=names       clusters to issue commands to. Implies --local.
                             NOTE: SlurmDBD must be up.
  -n, --nodes=NODES          report on specific node(s)
  --noconvert                don't convert units from their original type
			     (e.g. 2048M won't be converted to 2G).
  -N, --Node                 Node-centric format
  -o, --format=format        format specification
  -O, --Format=format        long format specification
  -p, --partition=PARTITION  report on specific partition
  -r, --responding           report only responding nodes
  -R, --list-reasons         list reason nodes are down or drained
  -s, --summarize            report state summary only
  -S, --sort=fields          comma separated list of fields to sort on
  -t, --states=node_state    specify the what states of nodes to view
  -T, --reservation          show only reservation information
  -v, --verbose              verbosity level
  -V, --version              output version information and exit

Help options:
  --help                     show this help message
  --usage                    display brief usage message

其中常用的有-p和-q,分别代表查看特定分区和特定优先级。

查询结果中PARTITION 表示分区，NODES 表示结点数，NODELIST 为结点列表， STATE 表示结点运行状态。其中，idle 表示结点处于空闲状态，alloc 表示结 点已经分配了一个或多个作业。

提交作业

使用srun命令

srun命令使用示例：

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srun -N 2 -n 24 -p debug -q debug programname < inputfile

其中N表示申请节点数，n表示总进程数，c表示每个核分配的进程数，q表示任务分区（不同任务分区可运算时间不一样），q表示qos任务优先级，inputfile表示屏幕输出保存的文件（不指定也可）。

使用批处理作业命令sbatch

先创建一个sh脚本文件，然后写入

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# !/bin/bash

#SBATCH -J name

具体参数如下

作用 命令
指定任务名称 #SBATCH -J name
指定队列/分区 #SBATCH -p cpu
指定 QoS #SBATCH –qos=debug或者#SBATCH -q debug
最长运行时间 #SBATCH -t 5:00
指定节点数量 #SBATCH -N 1
指定每个CPU 核心进程数 #SBATCH –cpus-per-task=4
指定每个节点进程数 #SBATCH –ntasks-per-node=24
输出文件 #SBATCH -o test.out

查看作业状态

使用squeue命令

取消作业

使用scancel命令，示例：

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scancel [jobid]
scancel 98833434

查看之前作业

使用sacct命令